Lycéen passionné de jeux vidéo, Akira est enlevé par une mystérieuse organisation. Ses compagnons d'infortune et lui sont radiés des registres de la population et deviennent des sujets d'expérimentation au sein d'un jeu d'un genre nouveau, se découvrant chacun à leur tour des pouvoirs dévastateurs. Akira tente d'utiliser ses nouvelles facultés pour détruire ceux qui les retiennent captifs.